Presidentkandidat Andrés Manuel López Obrador fra Demokratisk venstreparti ble slått av PRIs kandidat Enrique Peña Nieto, men Obrador nektet å godta nederlaget og krevde ny stemmeopptelling.
Valgkommisjonen bestemte at over halvparten av stemmene skulle telles på nytt.
Da resultatet fra 97 prosent av valglokalene var klart torsdag ettermiddag, ledet Peña Nieto med nesten 7 prosentpoeng.
«Skittent valg»
Obrador hevdet valget var «skittent» og preget av uregelmessigheter. Ifølge Obrador brukte PRI flere millioner pesos på å kjøpe stemmer for sin kandidat.
Han mener også at mediene sterkt favoriserte Peña Nieto og PRI i sin dekning i forkant av valget.
I 2006 nektet López Obrador å anerkjenne seieren til nåværende president Felipe Calderón, og han arrangerte demonstrasjoner som lammet Mexico by i mer enn en måned.
- Les også: Autoritært parti vant
Narkotikagjenger
Narkotikasmugling er et stort problem i Mexico, og de siste seks årene har over 55.000 mennesker mistet livet i kampen mot narkotikasmuglingen og kartellene, og mellom disse.
Tusenvis av politimenn var på jobb i forbindelse med valgavviklingen, på grunn av frykt for at narkotikagjenger ville lage uro.
Det knyttes stor spenning til hvorvidt vinneren av presidentvalg vil kunne få kontroll på det voldsherjede landet.
Krigen mot narkotikakriminaliteten som Calderón innledet for seks år siden, har bare gjort volden verre og ført til at titusenvis av sivile er dratt inn i voldshandlingene. Samtidig har narkokartellene fått økt makt.