Colombias president Juan Manuel Santos la mandag fredsforhandlingene med geriljaen på is fordi general Ruben Dario Alzatas, en militærtjenestemann og en sivilist hadde blitt bortført dagen før.
– De tre ble tatt til fange av våre styrker etter at de ble identifisert, på grunnlag av at de var militære fiender som oppholdt seg i et krigsområde, heter det i en uttalelse på FARCs hjemmeside.
Generalen ble tatt til fange etter at han gikk i land fra en båt nær byen Quibdo under et besøk i et område hvor det foregår et energiprosjekt, ifølge forsvarsminister Juan Carlos Pinzon.
De to andre som ble tatt til fange, hadde også vært på båten.
Feliz Antonio Muños i FARC sa på en pressekonferanse tidligere på dagen at geriljaen ønsker å gjenoppta fredsforhandlingene i Cubas hovedstad Havanna.
Han sa da at FARC ikke har noen opplysninger om den bortførte generalen.
Årsaken til de motstridende opplysnigene oppgis å være dårlig kommunikasjon i området hvor regjeringen sier han ble bortført.
Fredssamtalene har som mål å få en slutt på den 50 år lange konflikten mellom Colombias regjering og den venstreorienterte FARC-geriljaen. Forhandlingene begynte i Norge i 2012, og norske myndigheter bistår partene i fredsprosessen.